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真菌 ITS 通用引物有哪些

目前常用的真菌ITS通用引物为ITS4和ITS5, 这两条引物用于普通真菌DNA测序,一般的DNA测序都用这两条,而且也不贵。 但是不知道你做的是那个类群的真菌,一般大型真菌DNA测序几乎都用ITS4和ITS5,但是微型真菌就不一定了,你最好在GenBank里先查...

也想知道

这个PCR产物很特异,不用怀疑你的结果。和文献有出入不奇怪,可能是你用的菌株不同所致。

可以用ITS1跟4,这个引物是通用引物,你在生工或者其他公司合成时对方应该是有现货的,不提供序列也可以的。如果实在需要,在网上随便查查吧,挺容易找到的。条件设置就按照常规的就行,这对引物还是很皮实的,一般都能扩出来,开始可以试一下95...

真菌18s扩增常用的引物有 NS1、NS8,1.8kb NS1:GTAGTCATATGCTTGTCTC NS8:TCCGCAGGTTCACCTACGGA NS1、NS4,1.1kb NS1:GTAGTCATATGCTTGTCTC NS4:CTTCCGTCAATTCCTTTA AG

有NS1、NS8和NS1、GC Fung

1.不同真菌的ITS片段大小是不一样的,大小在500-750bp之间,个别在1000左右 2.土壤样品的DNA提取物用ITS1和ITS4这对引物扩增在500-750bp大都有2个目标条带是正常的,因为土壤中的真菌种类很多,所以条带会多,而且普通电泳无法区分,所以用切胶...

blastp试试

可以试一下8碱基或者6碱基的随机引物,但是扩增产物的长度也是随机的,从一两百到七八百长度的片段都有

现在均有现成的提取试剂盒,卖kit的公司有:大连宝生物;OMEGA;天根等;如果进行测序,那么在提取真菌DNA后,再采用下面的引物进行PCR扩增,得到目的片段后再进行测序。 Primer名称序列(5'to3') ITS1TCCGTAGGTGAACCTGCGG ITS4TCCTCCGCTTATTGATA...

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