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我做真菌分子生物学鉴定,用引物ITS1和ITS4测序结...

blastp试试

1.不同真菌的ITS片段大小是不一样的,大小在500-750bp之间,个别在1000左右 2.土壤样品的DNA提取物用ITS1和ITS4这对引物扩增在500-750bp大都有2个目标条带是正常的,因为土壤中的真菌种类很多,所以条带会多,而且普通电泳无法区分,所以用切胶...

我搞真菌的,可以相互探讨一下。曾大致了解土壤真菌,一般是取回土样,经过一些处理后提取DNA再做分子鉴定。有什么问题呢?

目前常用的真菌ITS通用引物为ITS4和ITS5, 这两条引物用于普通真菌DNA测序,一般的DNA测序都用这两条,而且也不贵。 但是不知道你做的是那个类群的真菌,一般大型真菌DNA测序几乎都用ITS4和ITS5,但是微型真菌就不一定了,你最好在GenBank里先查...

不好意思,不太用这个账号了,没看到。应该已经解决了吧。请使用NCBI BLASTn.将序列输入,在基因组选项勾选other即可,默认的对照基因组是人类和小鼠。

看测序结果与目的基因序列是否一致,有没有碱基突变。

联合形态,18S,ITS,还有个别持家基因。有个同学他导师是海德 . 凯文,水生真菌的权威,就是这样做的。需要帮忙可留言

测序是指测DNA的序列或者蛋白质的序列,需要首先将DNA或蛋白纯化后才能进行,不是区分细菌死活的方法,无法区分,也就是将死菌和活菌的DNA都包括在内了。

再建立进化树的工作时,就是通过基因的序列同源性来判断不同物种之间的进化关系的远近的。所以测序得到序列后,首先要做的事情就是BLAST。

这个我记不零清了,算算很简单的,生物信息学课本上有详细例题的。你到图书馆借个课本,对着做就好了,很好理解的。我学过挺久了,怕给你讲错了

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